Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA1P25391 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA1P25391 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA1P25391 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA1P25391 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA1P25391 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms