Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNCP24863 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNCP24863 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNCP24863 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNCP24863 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNCP24863 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNCP24863 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNCP24863 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms