Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5F1P24539 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms