Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLDCP23378 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLDCP23378 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLDCP23378 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLDCP23378 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLDCP23378 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLDCP23378 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms