Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP4AP20648 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms