Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM21P19474 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms