Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FLT1P17948 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FLT1P17948 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FLT1P17948 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FLT1P17948 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FLT1P17948 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FLT1P17948 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FLT1P17948 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FLT1P17948 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FLT1P17948 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FLT1P17948 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FLT1P17948 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FLT1P17948 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FLT1P17948 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FLT1P17948 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms