Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA1P17096 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA1P17096 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms