Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF35P13682 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF35P13682 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms