Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT3P12035 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT3P12035 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT3P12035 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT3P12035 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms