Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CT47B1P0C2W7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CT47B1P0C2W7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms