Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSLP07711 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSLP07711 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSLP07711 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSLP07711 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTSLP07711 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSLP07711 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSLP07711 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSLP07711 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSLP07711 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms