Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAVP06756 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAVP06756 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms