Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLBP06746 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLBP06746 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLBP06746 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLBP06746 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLBP06746 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLBP06746 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLBP06746 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLBP06746 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLBP06746 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLBP06746 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLBP06746 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLBP06746 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms