Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCNP04198 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCNP04198 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCNP04198 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYCNP04198 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYCNP04198 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms