Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRUB2O95900 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRUB2O95900 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms