Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms