Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX6O95503 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX6O95503 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX6O95503 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX6O95503 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX6O95503 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX6O95503 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX6O95503 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX6O95503 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX6O95503 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX6O95503 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX6O95503 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX6O95503 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX6O95503 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX6O95503 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX6O95503 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX6O95503 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms