Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4BO95155 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4BO95155 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms