Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP2O95045 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPP2O95045 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPP2O95045 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP2O95045 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP2O95045 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP2O95045 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP2O95045 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UPP2O95045 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP2O95045 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP2O95045 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP2O95045 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP2O95045 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP2O95045 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP2O95045 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms