Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMTA2O94983 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMTA2O94983 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMTA2O94983 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms