Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG12O94817 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG12O94817 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG12O94817 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms