Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOO75962 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOO75962 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms