Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms