Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USO1O60763 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USO1O60763 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USO1O60763 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USO1O60763 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USO1O60763 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USO1O60763 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USO1O60763 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USO1O60763 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USO1O60763 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USO1O60763 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USO1O60763 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USO1O60763 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USO1O60763 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USO1O60763 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms