Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1O43719 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms