Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA3O43365 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA3O43365 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms