Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRTM2O43300 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRTM2O43300 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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