Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRXO43186 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRXO43186 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRXO43186 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRXO43186 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRXO43186 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms