Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEFVO15553 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEFVO15553 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEFVO15553 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEFVO15553 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEFVO15553 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEFVO15553 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEFVO15553 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEFVO15553 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEFVO15553 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms