Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF6O14896 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF6O14896 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF6O14896 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF6O14896 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF6O14896 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF6O14896 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF6O14896 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF6O14896 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms