Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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