Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL1O00548 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL1O00548 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL1O00548 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL1O00548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL1O00548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DLL1O00548 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DLL1O00548 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL1O00548 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL1O00548 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms