Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHL1O00533 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHL1O00533 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHL1O00533 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHL1O00533 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHL1O00533 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHL1O00533 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHL1O00533 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHL1O00533 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHL1O00533 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHL1O00533 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHL1O00533 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHL1O00533 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms