Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF10AO00220 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms