Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNAP23O00161 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms