Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms