Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
E9PCH4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
E9PCH4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
E9PCH4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
E9PCH4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
E9PCH4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
E9PCH4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
E9PCH4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
E9PCH4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
E9PCH4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
E9PCH4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
E9PCH4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
E9PCH4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
E9PCH4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
E9PCH4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
E9PCH4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
E9PCH4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
E9PCH4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
E9PCH4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
E9PCH4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
E9PCH4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
E9PCH4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms