Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms