Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DGG1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DGG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DGG1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DGG1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DGG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B4DGG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B4DGG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B4DGG1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B4DGG1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B4DGG1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B4DGG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DGG1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms