Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3P2A8K0S8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms