Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC169A6NNP5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms