Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms