Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA8A3KMH1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms