Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms