Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Setbp1Q9Z180 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Setbp1Q9Z180 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
Setbp1Q9Z180 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Setbp1Q9Z180 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Setbp1Q9Z180 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Setbp1Q9Z180 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Setbp1Q9Z180 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Setbp1Q9Z180 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Setbp1Q9Z180 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Setbp1Q9Z180 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Setbp1Q9Z180 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Setbp1Q9Z180 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Setbp1Q9Z180 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Setbp1Q9Z180 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Setbp1Q9Z180 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Setbp1Q9Z180 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Setbp1Q9Z180 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Setbp1Q9Z180 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Setbp1Q9Z180 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Setbp1Q9Z180 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Setbp1Q9Z180 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Setbp1Q9Z180 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Setbp1Q9Z180 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
Setbp1Q9Z180 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Setbp1Q9Z180 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Setbp1Q9Z180 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Setbp1Q9Z180 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Setbp1Q9Z180 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Setbp1Q9Z180 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Setbp1Q9Z180 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Setbp1Q9Z180 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Setbp1Q9Z180 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Setbp1Q9Z180 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Setbp1Q9Z180 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Setbp1Q9Z180 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Setbp1Q9Z180 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Setbp1Q9Z180 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Setbp1Q9Z180 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Setbp1Q9Z180 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Setbp1Q9Z180 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Setbp1Q9Z180 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Setbp1Q9Z180 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms