Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AireQ9Z0E3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AireQ9Z0E3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AireQ9Z0E3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AireQ9Z0E3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AireQ9Z0E3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AireQ9Z0E3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AireQ9Z0E3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AireQ9Z0E3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AireQ9Z0E3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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