Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ2

Psmd13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd13Q9WVJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd13Q9WVJ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd13Q9WVJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmd13Q9WVJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd13Q9WVJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd13Q9WVJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmd13Q9WVJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd13Q9WVJ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmd13Q9WVJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd13Q9WVJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms