Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsjQ9R014 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsjQ9R014 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtsjQ9R014 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsjQ9R014 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsjQ9R014 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsjQ9R014 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsjQ9R014 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms