Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nectin3Q9JLB9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nectin3Q9JLB9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nectin3Q9JLB9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nectin3Q9JLB9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nectin3Q9JLB9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nectin3Q9JLB9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nectin3Q9JLB9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms